Les « .pyc » sont des fichier « Core » de Python, comme la dit @jelopo le dossier /usr, comme /etc sont des dossier systèmes (tout comme /var), tu peux éditer les sources si tu sais comment corrigé un bug (arrivé avec une librairie Python), mais tu ne doit pas les effacers. Sauf si il sont dans un dossier de projet, dans le /home, et qu’il n’ont pas été installé via un logiciel comme « pip ».
Tu trouvera par exemple des .pyc dans des projets, car il inclus dans ce dernier les librairies associés, à fin de faire marcher le code sans devoir installer des pré-requis ou que le code exige des versions précises ou modifiés. En bref, les fichiers .pyc sont important et ne sont pas des versions utilisable comme les simple .py, qui sont des scripts commun.